清华大学、北京大学、浙江大学以稳定的优势，连续8年保持中国大学前三名。进入前10名的大学依次还有：第4名上海交通大学，第5名南京大学，第6名复旦大学，第7名华中科技大学，第8名武汉大学，第9名吉林大学，第10名西安交通大学。清华大学已经连续11年位居榜首，与上一年度的前10名相比，前四名不变，第7、8、9名不变。南京大学由第6名上升到第5名，复旦大学由第5名下降到第6名，西安交通大学进入前10名，中山大学没有进入前10名。

　　《中国大学评价》课题组组长武书连指出，本年度清华大学得分上升近30分的原因是北京协和医学院的临床医学得分计入了清华大学。2006年中国协和医科大学更名为北京协和医学院，又名清华大学北京协和医学院，自2007年开始，以清华大学北京协和医学院的名义招收临床医学本科生和研究生。因此，《中国大学评价》课题组将北京协和医学院的临床医学部分计入清华大学。北京协和医学院的基础医学、预防医学、生物学等不以清华大学的名义招生，不计入清华大学得分。

　　他说，与合并相反，中国地质大学原在武汉和北京的两个校区经教育部行文，已经正式成为两个独立的办学实体。校名分别为：中国地质大学（武汉）、中国地质大学（北京）。因此，自2007年度起，对中国地质大学（武汉）、中国地质大学（北京）都单独评价。不过，原中国地质大学是211工程大学，分开后的两所大学是否都是211工程大学还未见正式公布，课题组暂均以211工程大学对待之。

　　《中国大学评价》课题组首次公布了南方医科大学（原第一军医大学）的名次。在拥有100多所211工程大学、强校如林的中国普通高校中，并非211工程大学的南方医科大学进入前80名，显示该校有着很强的实力。

　　《中国大学评价》课题组同时评出了16所2007年中国一流大学。中山大学、南开大学以研究1型首次进入中国一流大学。上年度，中国协和医科大学是中国一流大学，更名为清华大学北京协和医学院后，不再单独评价。

　　以武书连为组长的《中国大学评价》课题组还评出了35所2007年中国研究型大学。湖南大学首次进入研究型大学，该校是985工程大学。上年度，中国协和医科大学、中国地质大学是研究型大学。在中国协和医科大学更名为清华大学北京协和医学院后，不再单独评价。中国地质大学分为中国地质大学（武汉）、中国地质大学（北京）两个学校后，都没有进入研究型大学。

　　与上年相比，中国大学前100名中，只有中国药科大学因中国地质大学一分为二且二校都进入前100名、南方医科大学进入评价体系而跌至101名，其他大学都保持在前100名。

　　《中国大学评价》课题组同时完成了理学、工学、农学、医学、哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、管理学等十一个学科门类的排名。清华大学获得工学第一名，北京大学获得理学、医学、哲学、法学、文学第一名，中国农业大学获得农学第一名，中国人民大学获得经济学第一名，北京师范大学获得教育学、历史学第一名，西安交通大学获得管理学第一名。

　　课题组也对中国大学200多个本科专业进行了排名，北京大学、清华大学的本科专业第一名数量大幅领先其他大学。